Annet Pijper is als klinisch docent verbonden aan de master Orthopedagogiek. Zij is betrokken bij het vormgeven en verzorgen van klinisch onderwijs, zowel in de bachelor Pedagogische Wetenschappen als in de master Orthopedagogiek. In 2024-2025 is zij projectleider voor de doorontwikkeling van vernieuwd klinisch videomateriaal.

In de bachelor Pedagogische Wetenschappen is Annet onder andere betrokken bij diverse vakken in de klinische leerlijn, zoals Professionele Vaardigheden II en III, Diagnostiek en Psychotherapeutische stromingen. Tevens is zij begeleider van studenten binnen de bachelorstage. In de master is Annet betrokken bij de vakken Van Diagnostiek naar Behandeling I en II en bij de masterstage.