Locati, M. D., Pagano, J. F. B., Abdullah, F., Ensink, W. A., van Olst, M., van Leeuwen, S., ... Breit, T. M. (2018). Identifying small RNAs derived from maternal- and somatic-type rRNAs in zebrafish development. Genome, 61(5), 371-378. https://doi.org/10.1139/gen-2017-0202[details]
2017
Locati, M. D., Pagano, J. F. B., Ensink, W. A., van Olst, M., van Leeuwen, S., Nehrdich, U., ... Breit, T. M. (2017). Linking Maternal and Somatic 5S rRNA types with Different Sequence-Specific Non-LTR Retrotransposons. RNA, 23(4), 446-456. https://doi.org/10.1261/rna.059642.116[details]
Locati, M. D., Pagano, J. F. B., Girard, G., Ensink, W. A., van Olst, M., van Leeuwen, S., ... Breit, T. M. (2017). Expression of distinct maternal and somatic 5.8S, 18S, and 28S rRNA types during zebrafish development. RNA, 23(8), 1188-1199. https://doi.org/10.1261/rna.061515.117[details]
Bruning, O., Rodenburg, W., Wackers, P. F. K., van Oostrom, C., Jonker, M. J., Dekker, R. J., ... Breit, T. M. (2016). Confounding Factors in the Transcriptome Analysis of an In-Vivo Exposure Experiment. PLoS ONE, 11(1), [e0145252]. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0145252[details]
Pagano, J. F. B., Rauwerda, H., de Leeuw, W. C., Wackers, P., de Jong, M., Ensink, W., ... Breit, T. M. (2016). Transcriptome data on maternal RNA of 24 individual zebrafish eggs from five sibling mothers. Data in Brief, 8, 69-72. https://doi.org/10.1016/j.dib.2016.04.045[details]
Rauwerda, H., Wackers, P., Pagano, J. F. B., de Jong, M., Ensink, W., Dekker, R., ... Breit, T. M. (2016). Mother-Specific Signature in the Maternal Transcriptome Composition of Mature, Unfertilized Zebrafish Eggs. PLoS ONE, 11(1), [e0147151]. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0147151[details]
Bruning, O., Rauwerda, H., Dekker, R. J., de Leeuw, W. C., Wackers, P. F. K., Ensink, W. A., ... Breit, T. M. (2015). Valuable lessons-learned in transcriptomics experimentation. Transcription, 6(3), 51-55. https://doi.org/10.1080/21541264.2015.1064195[details]
Locati, M. D., Terpstra, I., de Leeuw, W. C., Kuzak, M., Rauwerda, H., Ensink, W. A., ... Dekker, R. J. (2015). Improving small RNA-seq by using a synthetic spike-in set for size-range quality control together with a set for data normalization. Nucleic Acids Research, 43(14), [e89]. https://doi.org/10.1093/nar/gkv303[details]
Dekker, R. J., Van Thienen, J. V., Rohlena, J., De Jager, S. C., Elderkamp, Y. W., Seppen, J., De Vries, C. J. M., Biessen, E. A. L., Van Berkel, T. J. C., Pannekoek, H., & Horrevoets, A. J. G. (2005). Endothelial KLF2 links local arterial shear stress levels to the expression of vascular tone-regulating genes. American Journal of Pathology, 167(2), 609-618. https://doi.org/10.1016/S0002-9440(10)63002-7
2014
Bruning, O., Rodenburg, W., van Oostrom, C. T., Jonker, M. J., de Jong, M., Dekker, R. J., ... Breit, T. M. (2014). A range finding protocol to support design for transcriptomics experimentation: examples of in-vitro and in-vivo murine UV exposure. PLoS ONE, 9(5), e97089. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0097089[details]
Breit, T. M., Rauwerda, J., Pagano, J. F. B., Ensink, W. A., Nehrdich, U., Spaink, H. P., & Dekker, R. J. (2020). Immunoglobulin switch-like recombination regions implicated in the formation of extrachromosomal circular 45S rDNA involved in the maternal-specific translation system of zebrafish. BioRxiv. https://doi.org/10.1101/2020.01.31.928739[details]
Pagano, J. F. B., Locati, M. D., Ensink, W. A., van Olst, M., van Leeuwen, S., de Leeuw, W. C., Nehrdich, U., Spaink, H. P., Rauwerda, H., Jonker, M. J., Dekker, R. J., & Breit, T. M. (2020). Maternal- and Somatic-type snoRNA Expression and Processing in Zebrafish Development. BioRxiv. https://doi.org/10.1101/858936[details]
Breit, T. M., Pagano, J. F. B., van der Jagt, P. L., Mittring, E., Ensink, W. A., van Olst, M., van Leeuwen, S., de Leeuw, W., Nehrdich, U., Spaink, H. P., Rauwerda, H., & Dekker, R. J. (2019). New observations on non-coding RNAs involved in the dual translation system in zebrafish development. BioRxiv. https://doi.org/10.1101/869651[details]
Pagano, J. F. B., Dekker, R. J., Ensink, W. A., van Olst, M., Bos, A., van Leeuwen, S., de Leeuw, W. C., Nehrdich, U., Spaink, H. P., Rauwerda, H., Jonker, M. J., & Breit, T. M. (2019). An alternative spliceosome defined by distinct snRNAs in early zebrafish embryogenesis. BioRxiv. https://doi.org/10.1101/858944[details]
De UvA maakt gebruik van cookies en daarmee vergelijkbare technieken voor het functioneren, meten en optimaliseren van de website. Ook worden er cookies geplaatst om bijv. YouTube filmpjes te kunnen tonen en voor marketingdoeleinden. Deze laatste categorie betreffen de tracking cookies. Uw internetgedrag kan worden gevolgd door middel van deze tracking cookies. Door op “Accepteer alle cookies” te klikken gaat u hiermee akkoord. Lees ook het UvA Privacy statement
Noodzakelijk
Cookies noodzakelijk voor het basisfunctioneren van de website. Deze cookies worden bijvoorbeeld ingezet om het inloggen voor studenten en medewerkers mogelijk te maken.
Noodzakelijk & Optimalisatie
Cookies die worden geplaatst om anoniem gegevens te verzamelen over het gebruik van de website om deze te verbeteren.
Noodzakelijk & Optimalisatie & Marketing
Cookies die in staat stellen bezoekers te volgen en van gepersonaliseerde advertenties te voorzien. Externe advertentienetwerken verzamelen individuele gegevens over internetgedrag. Selecteer deze categorie om YouTube video's te kunnen kijken.