Aukje van Rooden is gespecialiseerd in hedendaagse continentale, met name Franse, filosofie en de toepassing daarvan binnen de literatuur- en cultuurwetenschappen. Geïnspireerd door de filosofische traditie die begint bij de Duitse Romantiek en Nietzsche, maar vooral ook door de post-Heideggeriaanse Franse filosofie van Jean-Luc Nancy en Maurice Blanchot, beschouwt zij taal, en meer specifiek het literaire gebruik van taal, als het kenmerkende aspect van het menselijk bestaan, met name in de moderne samenleving. In haar (her)conceptualisatie van de moderne menselijke conditie heeft zij een onderzoekslijn ontwikkeld die zich met name richt op kwesties als relationaliteit, gemeenschap en engagement. Zij heeft de rol van het literaire, in relatie tot het politieke en het sociale, onderzocht in het werk van onder meer Sartre, Blanchot, Bataille, Lyotard, Nancy, Lacoue-Labarthe, Foucault, Badiou en Rancière. Haar werk is gepubliceerd in tijdschriften als Littérature, Spiegel der Letteren, Theory & Event, Angelaki, Journal of the History of Ideas en Cultural Politics. Van Rooden heeft de volgende boeken gepubliceerd: 

Nieuw boek:

• The Unraveled Plot: Thinking Literature, Community, and Politics with Jean-Luc Nancy (State University of New York Press, oktober 2025). 

Overige boeken:

• L'Intrigue dénouée. Mythe, littérature et communauté dans la pensée de Jean-Luc Nancy (Brill 2022)
• Literature, Autonomy, and Commitment (Bloomsbury 2019)
• Literatuur, autonomie en engagement: Pleidooi voor een nieuw paradigma (Amsterdam University Press 2015)
• Re-treating Religion: Deconstructing Christianity with Jean-Luc Nancy (Fordham University Press 2012, mede-redacteur)
• Maurice Blanchot: De stem en het schrift (Klement 2012, co-auteur)
• De nieuwe Franse Filosofie: Denkers en thema's voor de 21e eeuw (Boom 2011, mede-redacteur)

Van Rooden was onderzoeker aan de Universiteit Utrecht (2010-2012), Radboud Universiteit (2006-2009), Université Paris VIII-Vincennes-Saint-Denis (2008) en Université Paris IV-Sorbonne (2004-2005), en docent aan de Kunstacademie Avans-St Joost (2005). Ze is lid van de wetenschappelijke adviesraden van het Tijdschrift voor Filosofie en van het Maurice Blanchot Archief in Parijs. Van Rooden is ook vertaler uit het Frans (van werken van Blanchot, Nancy en Rancière) en een van de hoofdredacteuren van de Nederlandse uitgeverij Parresia (die werken publiceert van onder meer Blanchot, Foucault, Cixous, Irigaray, Duras en Badiou).

Aan het Filosofiedepartement van de Universiteit van Amsterdam was zij vicevoorzitter van de capaciteitsgroep Critical Cultural Theory (2017-2021) en programmacoördinator van de Research Master Philosophy (2014-2021).    

Aukje van Rooden heeft een doctoraal in Filosofie en Literatuur- en Cultuurwetenschappen (beide met de hoogste onderscheiding). Ze promoveerde in 2010 aan de Universiteit van Tilburg (eveneens met de hoogste onderscheiding).

Ik sta open voor (zelf gefinancierde) promovendi voor begeleiding op het gebied van het werk van Nancy, Blanchot, continentale filosofie en literatuur of literatuurtheorie.