Amy Zeegelaar werkt als beleidsmedewerker onderzoek en valorisatie bij de afdeling Academische Zaken, onderdeel van het cluster Beleid- en Strategieontwikkeling. Zij ondersteunt het College van Bestuur, in het bijzonder de rector magnificus, bij het voorbereiden en ontwikkelen van strategisch beleid van de instelling op het gebied van het onderzoek en valorisatie.
Onder haar taken en verantwoordelijkheden vallen onder meer de coördinatie van onderzoeksevaluaties, valorisatie, promovendibeleid, prijsvoordrachten en interuniversitaire onderzoeksscholen. Daarnaast neemt Amy Zeegelaar deel aan universiteitsbrede projecten, ondersteunt ze de Centrale Promovendiraad (CPC) en is ze secretaris van de Universitaire Valorisatiecommissie (UVC).